Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4604672	4604859	188	39 [0]	[0] 26	yjjA	conserved hypothetical protein

CCAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCTT  >  W3110S.gb/4604610‑4604671                                                              | ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:542059/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:100190/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:212230/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:331077/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:345198/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:402553/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:408232/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:51205/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:525453/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:537120/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1637745/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:59798/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:821443/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:821576/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:849299/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:870171/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:899733/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:941585/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:952431/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1273053/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:106683/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1112256/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1165451/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1172354/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1200623/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1232544/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1256351/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1258117/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1615163/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:129176/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1402270/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1446753/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1458754/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1465212/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1488022/62‑1 (MQ=255) ccAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1494539/62‑1 (MQ=255)   aGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:716681/60‑1 (MQ=255)   aGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:1610447/60‑1 (MQ=255)           cTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCtt  <  1:239978/52‑1 (MQ=255)                                                              | CCAGCTTTTGCTTCGCGCAGTATTGCAGAATGCCTGCGGCATTGTTCATGTTATCTGCGCTT  >  W3110S.gb/4604610‑4604671

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑