Missing coverage evidence...
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GCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTCG  >  W3110S.gb/4613182‑4613243                                                              | gCTTCACACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1616590/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCTCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:730213/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGTCGACGATTcg  <  1:145842/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:479607/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1525251/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1009499/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1583933/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1588553/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1604508/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:324623/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:335170/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:391147/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1583591/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:580609/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:678544/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:755951/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:865124/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:90382/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:955729/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:955998/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:980903/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1518497/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1073221/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1091770/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1093401/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:116269/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1219315/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1224324/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1235287/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1247095/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1262108/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1263252/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1263332/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1293127/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1294647/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1362050/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:143201/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1494017/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1523785/62‑1 (MQ=255) gCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCATGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:838005/62‑1 (MQ=255) acTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:973913/61‑1 (MQ=255)  cTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:470439/61‑1 (MQ=255)  cTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:1250019/61‑1 (MQ=255)            tGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTcg  <  1:835268/51‑1 (MQ=255)                                                              | GCTTCAAACGCTGCCGCCATTGCCCTGTACGAAAGTTTAGGCTTTAACGAGGCGACGATTCG  >  W3110S.gb/4613182‑4613243

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑