Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	136488	136566	79	42 [0]	[0] 56	speE/yacC	spermidine synthase/hypothetical protein

GTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAAC  >  W3110S.gb/136426‑136487                                                              | gacGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1409842/3‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:462083/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1616986/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:21593/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:298053/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:301182/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:330419/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:381441/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:42973/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:431584/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:171958/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:516308/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:541090/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:585867/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:72009/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:76827/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:800763/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:842045/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:952221/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:969055/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1231316/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1097477/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1136004/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1142264/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1148087/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1176681/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1188411/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1213426/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1216820/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1592427/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:140757/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1420214/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1445823/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:145262/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1461509/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1469129/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:149759/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:1519651/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCGCCTTTGTTAac  >  1:1089704/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTAGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:628720/1‑62 (MQ=255) gTCGTGTAGCGGTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:22307/1‑62 (MQ=255) gTCGTGGAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAac  >  1:908000/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTCGTGTAGCGTTTCATGCCACTGTTTTTTTTCGGCCATGGGTTGATACCTCCTTTGTTAAC  >  W3110S.gb/136426‑136487

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑