Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	153925	154542	618	75 [0]	[0] 126	htrE	predicted outer membrane usher protein

CGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATG  >  W3110S.gb/153863‑153924                                                              | cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:292080/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:480971/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:480683/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:462929/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:439321/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:424587/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:407308/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:398446/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:341867/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:303252/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:491171/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:258247/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:250354/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:2036/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:192061/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1612170/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1611096/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1609095/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1006823/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:754518/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:974420/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:924607/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:914832/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:863799/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:84833/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:842232/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:841572/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:768424/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1578279/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:724178/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:713754/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:700664/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:672683/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:650773/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:574352/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:559131/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:491237/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1165236/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:156248/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1277665/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1256394/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:124494/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1241707/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1210330/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1191375/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1190742/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1290276/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1161430/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1145825/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1130401/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1130399/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1059480/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:105849/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1034888/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1021527/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:138195/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1534869/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:152470/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1518903/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1506007/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1497746/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1473899/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1469902/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1442136/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1292218/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1365005/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1337000/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1335742/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1331870/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1304640/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1292458/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTTTTTTCTAAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:146505/62‑1 (MQ=255) cGTAATCTCTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:649581/62‑1 (MQ=255)                        aaCGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:1255908/39‑1 (MQ=255)                        aaCGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATg  <  1:467273/39‑1 (MQ=255)                                                              | CGTAATCTTTTTTCTCAAATTTCAACGGTTGGTTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATG  >  W3110S.gb/153863‑153924

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑