Missing coverage evidence...
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TTACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGT  >  W3110S.gb/156159‑156220                                                              | ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:617962/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:209550/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:212092/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:312380/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:317993/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:379634/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:430281/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:466085/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:594639/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:189182/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:760192/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:82985/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:872285/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:931136/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:97510/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:975673/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:998874/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1009456/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1644257/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1562807/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1561211/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1552209/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1443866/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1419116/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1251831/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1240282/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1217878/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1168712/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1084301/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1074867/62‑1 (MQ=255) ttACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1051743/62‑1 (MQ=255)  tACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1208812/61‑1 (MQ=255)  tACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGt  <  1:1171366/61‑1 (MQ=255)                                                              | TTACGAAGCATAAAGCTGTTGTATGTTTGGTGTTAAAAAACATAAACCATCCCTGATAGAGT  >  W3110S.gb/156159‑156220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑