Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	200045	200084	40	61 [0]	[0] 74	yaeT	conserved hypothetical protein

TATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGT  >  W3110S.gb/199983‑200044                                                              | tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:694526/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:101489/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:472663/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:49880/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:502501/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:505111/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:530222/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:530387/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:548305/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:555383/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:558700/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:585982/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:590309/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:610011/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:641611/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:335951/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:696685/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:737806/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:774079/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:78304/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:793351/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:820829/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:829930/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:838651/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:849957/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:852324/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:859210/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:887340/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:963664/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:981844/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1321154/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1042179/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:10620/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1062274/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1076095/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1118082/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1130387/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1132305/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:115710/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1192151/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1193982/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1203488/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1247066/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1293826/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:33055/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1399820/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1424795/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:146190/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1559927/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1564667/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1570806/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1612003/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1621917/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:16382/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:264969/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:29096/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:30193/62‑1 (MQ=255) tATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGAGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:784626/62‑1 (MQ=255)  aTGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1407191/61‑1 (MQ=255)   tGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGAGCTGTGTAAATCGGATGATGCTGt  <  1:1356870/60‑1 (MQ=255)                     tCAGGACGGCGCGATAGACCTGTGTATATCGGATGATGCTGt  <  1:748561/42‑1 (MQ=255)                                                              | TATGATTACGAATGTGCGACTCAGGACGGCGCGAAAGACCTGTGTAAATCGGATGATGCTGT  >  W3110S.gb/199983‑200044

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑