Missing coverage evidence...
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TTCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACG  >  W3110S.gb/208463‑208524                                                              | ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:7084/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:356001/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1080441/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:401535/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:406975/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:416826/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:468549/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:494002/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:533315/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:567908/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:640208/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:378121/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:71324/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:730109/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:773635/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:776832/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:792863/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:85529/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:877405/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:878073/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:919177/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1519111/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1088039/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1222707/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1223638/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1229575/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:136773/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1405388/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1409884/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1459114/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1505537/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1507419/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:355721/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1521254/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1536272/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:1636503/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:175594/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:213103/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:214857/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:219641/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:314227/62‑1 (MQ=255) ttCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTAGGCGCGACg  <  1:585878/62‑1 (MQ=255)  tCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:451486/61‑1 (MQ=255)    cAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:579311/59‑1 (MQ=255)        aCATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACg  <  1:814060/55‑1 (MQ=255)                                                              | TTCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGATGCACGCGCGCGGTTGCGTTTTGGCGCGACG  >  W3110S.gb/208463‑208524

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑