Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	245626	245639	14	36 [0]	[0] 21	yafK	conserved hypothetical protein

CCTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAT  >  W3110S.gb/245564‑245625                                                              | ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:596816/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:171874/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:176920/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:355262/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:38929/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:419513/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:465270/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:498422/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:558900/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1064573/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:625286/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:645316/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:645565/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:700865/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:724222/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:810868/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:959142/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1598782/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1004672/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1111453/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1130680/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1251108/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:125886/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1350095/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1355434/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1365056/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:148272/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1484070/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1508192/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1536423/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1537911/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1571011/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1647620/62‑1 (MQ=255) ccTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGACGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:992775/62‑1 (MQ=255)  cTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:982723/61‑1 (MQ=255)       ccgccgGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAt  <  1:1404820/56‑1 (MQ=255)                                                              | CCTAAGCCGCCGGAATATTTACAGATTTTATAGCTGTCGAGCAGTTGATATTGCTCGCCCAT  >  W3110S.gb/245564‑245625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑