Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	246331	246379	49	44 [0]	[0] 10	dinJ	predicted antitoxin of YafQ‑DinJ toxin‑antitoxin system

ATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGG  >  W3110S.gb/246269‑246330                                                              | atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCGATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:775897/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:540163/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:23758/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:252981/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:281185/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:285423/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:306249/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:338377/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:379140/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:417472/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:422553/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:513694/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1058125/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:65005/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:775372/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:781257/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:792637/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:797820/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:807302/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:810574/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:988860/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1357095/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:101090/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1070266/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1176030/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1193690/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1200176/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1231586/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1274760/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1312201/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:202241/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1384767/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1454250/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1461315/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:146778/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1594536/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1615966/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1619101/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1633913/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAACgg  <  1:901165/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTATTTGATTGATTGAATgg  <  1:221316/62‑1 (MQ=255) atcGGCGTCTTTGGCCTTATCAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1473921/62‑1 (MQ=255)  tcGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCATTGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1326488/61‑1 (MQ=255)            tGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATgg  <  1:1283343/51‑1 (MQ=255)                                                              | ATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGG  >  W3110S.gb/246269‑246330

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑