Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 410237 410581 345 63 [0] [0] 182 [mak]–[araJ] [mak],[araJ]

CAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAG  >  W3110S.gb/410175‑410236
                                                             |
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCTGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:763526/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:567481/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:296488/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1057197/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:340491/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:394655/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:430394/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:43435/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:447681/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:462655/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:473638/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:474275/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:514510/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:538630/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:56099/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:564301/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:308008/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:569397/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:601812/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:670715/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:678798/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:722406/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:733299/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:738632/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:771422/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:836531/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:862385/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:935383/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:961463/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:999711/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1451912/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1066816/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1072478/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1155862/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1186629/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1235700/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:124686/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1249572/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1259067/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1297421/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1298350/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1322119/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1325497/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1388651/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1402219/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:285189/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1601126/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:280364/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:256167/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1626842/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:161684/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1611175/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1466227/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1592707/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1576714/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1530501/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1521952/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1510050/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCAAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:1248928/62‑1 (MQ=255)
cAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAAAGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:469988/62‑1 (MQ=255)
 aaTTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:477247/61‑1 (MQ=255)
                         aaaCGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:415640/37‑1 (MQ=255)
                         aaaCGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAg  <  1:99923/37‑1 (MQ=255)
                                                             |
CAATTTGTCTTCGGCGGCGAATGTGAAACGCCGGTGCGTAAGGCGAAGCACGGTGATTCCAG  >  W3110S.gb/410175‑410236

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: