Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 448613 448804 192 148 [0] [1] 31 cyoB cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I

Only 100 of 148 total aligned reads displayed.

TAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGC  >  W3110S.gb/448553‑448612
                                                           |
gtggTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:45419/58‑1 (MQ=255)
     cATCCGTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:162761/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCGGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:938601/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCTCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1187800/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:274941/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:3910/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:366294/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:361532/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:337510/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:334389/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:314107/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:308856/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:294065/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:288483/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:277438/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:467530/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:242825/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:235167/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:228290/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:220220/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:206397/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1011608/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:179322/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:170795/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1644915/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:69138/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:9902/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:972343/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:957562/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:922965/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:797179/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:784265/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:724680/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:721493/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:714591/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:707516/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:408240/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:689756/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:673294/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:659156/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:639915/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:602101/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:588402/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:57672/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:536005/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:514792/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:192125/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1149880/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:140371/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1392201/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1643638/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1355140/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1345616/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1296764/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1293742/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1279489/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1267981/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1171498/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1370959/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1139077/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1115753/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1106248/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1098090/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:108378/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1079078/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1069388/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1068674/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1025995/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:101832/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1510564/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1618619/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1584531/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1561137/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1550438/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1548397/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:151205/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1486229/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1475364/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1454795/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1432696/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1412346/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1420907/55‑1 (MQ=255)
      aTCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:746018/54‑1 (MQ=255)
           tGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:217062/49‑1 (MQ=255)
               aaGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGATGTgc  <  1:1453903/45‑1 (MQ=255)
               aaGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:829734/45‑1 (MQ=255)
                agcagcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1104098/44‑1 (MQ=255)
                 gcagcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1426997/43‑1 (MQ=255)
                  cagcCTAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1577537/42‑1 (MQ=255)
                  cagcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1603213/42‑1 (MQ=255)
                    gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:522215/40‑1 (MQ=255)
                    gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:596133/40‑1 (MQ=255)
                    gcCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:569432/40‑1 (MQ=255)
                     ccGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1530959/39‑1 (MQ=255)
                     ccGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:398359/39‑1 (MQ=255)
                      cGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATTGAAGTgc  <  1:963859/38‑1 (MQ=255)
                      cGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:407288/38‑1 (MQ=255)
                      cGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1330663/38‑1 (MQ=255)
                       gAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1397152/37‑1 (MQ=255)
                        aaGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1601581/36‑1 (MQ=255)
                                                           |
TAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGC  >  W3110S.gb/448553‑448612

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: