Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	479566	479940	375	59 [0]	[0] 118	[ybaJ]	[ybaJ]

CGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAG  >  W3110S.gb/479505‑479565                                                             | cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCTGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:960717/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:633506/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:346589/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:34918/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:384888/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:394526/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:416620/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:44966/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:481397/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:511842/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:523232/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:524558/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:527636/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:53027/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:565923/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:632351/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:338278/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:636884/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:644384/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:697766/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:716307/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:747589/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:78065/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:791203/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:799114/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:80560/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:862464/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:913373/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:963487/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:975878/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1583445/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1068433/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1071598/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1106206/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1242379/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1247294/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1372282/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1396586/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1430142/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1441344/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1443857/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1445087/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1474719/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1502395/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1538156/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1038280/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1586550/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1603904/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1617213/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1618392/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:163168/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:1649315/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:174375/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:192517/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:214752/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:236114/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:242235/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:252003/1‑61 (MQ=255) cGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAg  >  1:291515/1‑61 (MQ=255)                                                             | CGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTCTAACAAG  >  W3110S.gb/479505‑479565

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑