Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 560770 561490 721 70 [0] [2] 137 sfmD predicted outer membrane export usher protein

TACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAA  >  W3110S.gb/560708‑560769
                                                             |
tACACCTGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1201268/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGTGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:511493/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:366093/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:603499/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:484247/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:456363/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:440630/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:43246/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:40996/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:605269/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:331503/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:314624/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:309422/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:256116/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:239511/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:209368/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:203152/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:604047/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1012604/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:729196/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:796135/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:803072/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:803565/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:811585/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:849450/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:857603/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:858354/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:906944/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:924365/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:924575/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:94597/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:968431/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:969521/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1509313/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1011685/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1025571/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1033695/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1060730/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1073058/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1099454/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1113650/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:11744/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1281236/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1291049/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1309316/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1380892/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1453286/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1482455/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:189019/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1552708/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:186039/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1582191/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1573958/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1514910/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1529489/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1529277/62‑1 (MQ=255)
tACACCCGGGAAAATGCGCTCCACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1526832/62‑1 (MQ=255)
 acacCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1334714/61‑1 (MQ=255)
 acacCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:402898/61‑1 (MQ=255)
 acacCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:413042/61‑1 (MQ=255)
 acacCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1474580/61‑1 (MQ=255)
 acacCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1264336/61‑1 (MQ=255)
 acacCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1567707/61‑1 (MQ=255)
 acacCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1601510/61‑1 (MQ=255)
 acacCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:457896/61‑1 (MQ=255)
  cacCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:205302/60‑1 (MQ=255)
          aaaaTGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1190550/52‑1 (MQ=255)
           aaaTGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1574596/51‑1 (MQ=255)
                  cTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:244679/44‑1 (MQ=255)
                           gcTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCaa  <  1:1528467/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
TACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAA  >  W3110S.gb/560708‑560769

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: