Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	562283	563261	979	17 [0]	[0] 47	[sfmH]–[fimZ]	[sfmH],sfmF,[fimZ]

GGTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTT  >  W3110S.gb/562222‑562282                                                             | ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:214983/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:908033/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:371908/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:338674/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:300913/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:289203/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:259980/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:251800/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:1084638/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:180415/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:178424/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:1572613/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:1570731/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:1391614/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:1324639/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:1157822/61‑1 (MQ=255) ggTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTAAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCtt  <  1:249770/61‑1 (MQ=255)                                                             | GGTGTCATGCCGCAAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTT  >  W3110S.gb/562222‑562282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑