Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 568809 569039 231 65 [0] [0] 50 ybcK predicted recombinase

CGCTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGAAAA  >  W3110S.gb/568746‑568808
                                                              |
cgcTCATTGAATGCTATAGCCAAGTATTTAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:741537/62‑1 (MQ=255)
 gcgcATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1223856/59‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCTAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:736539/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATTCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:369252/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCATGaaaa  <  1:401019/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:546791/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:658318/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:640578/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:620060/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:619256/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:610105/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:577171/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:706977/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:50951/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:495757/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:479807/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:462264/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:400872/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:689240/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:375014/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:711000/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:741782/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:750700/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:76763/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:796477/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:796644/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:808008/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:835142/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:862689/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:960694/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:964800/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:974362/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1491085/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1055292/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1072746/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1143407/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1162607/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1222646/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1237227/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1243690/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1298558/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:131453/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1357497/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1441977/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1447831/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1545794/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:218645/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:203477/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:231649/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:370412/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:357221/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:271466/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:330075/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:28850/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:327308/62‑1 (MQ=255)
 gcTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:300446/62‑1 (MQ=255)
  cTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:397197/61‑1 (MQ=255)
  cTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:510071/61‑1 (MQ=255)
  cTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:267094/61‑1 (MQ=255)
   tCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1265255/60‑1 (MQ=255)
     aTTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:434777/58‑1 (MQ=255)
       tGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1116469/56‑1 (MQ=255)
               aTAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1371059/48‑1 (MQ=255)
                     aaGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1122565/42‑1 (MQ=255)
                        tATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGaaaa  <  1:1054157/39‑1 (MQ=255)
                                                              |
CGCTCATTGAATGCAATAGCCAAGTATTTAAATGATCATGCTGTAAAGAATTTCTCAGGAAAA  >  W3110S.gb/568746‑568808

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: