Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	681693	681890	198	81 [0]	[0] 38	djlC	Hsc56 co‑chaperone of HscC

GCTGTTATGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTATT  >  W3110S.gb/681632‑681692                                                             | tcTGTTATGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1132369/60‑1 (MQ=255)       aTGTGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:712182/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:457657/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:722153/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:687549/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:655589/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:606929/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:603722/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:580051/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:556119/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:489913/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:458140/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1018779/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:260488/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:380422/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:357004/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:355826/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:299536/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:298809/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:297303/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:291214/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:875554/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:990184/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:987321/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:986985/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:976063/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:948420/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:942017/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:885760/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:880332/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:269025/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:86004/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:853128/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:842364/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:836879/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:834509/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:827005/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:775929/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:754784/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1153711/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:259696/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1378181/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1372367/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1366515/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1335395/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1332988/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1228366/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1192987/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1187412/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1155251/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1390906/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1133165/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1103632/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1073934/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1071945/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1062322/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1059236/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1024836/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1022131/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1021803/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1531983/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:235643/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:234389/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:216501/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:198509/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:187558/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:167849/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1620575/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1589739/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1559240/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1516446/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1515612/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:148819/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1473033/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1465536/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGGCAATCGTTTAtt  <  1:640347/55‑1 (MQ=255)       aTGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAAATATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:537523/55‑1 (MQ=255)       aTGAGCTGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:601573/55‑1 (MQ=255)       aTGAGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:599305/55‑1 (MQ=255)        tGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:1102149/54‑1 (MQ=255)           gCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTAtt  <  1:60191/51‑1 (MQ=255)                                                             | GCTGTTATGGGCGGAGATTTTACATAGCGGAAAATTATCGCCGTTAGGTCAATCGTTTATT  >  W3110S.gb/681632‑681692

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑