Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	740400	740402	3	54 [0]	[0] 91	phr	deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD‑binding

CTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGCC  >  W3110S.gb/740338‑740399                                                              | ccggCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:974765/60‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:188101/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:234089/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:224874/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1008516/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:268278/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:307424/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:361603/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:393841/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:409445/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:411316/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:510606/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:60092/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:606407/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:60924/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:609339/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:653517/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:668049/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:68149/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:683807/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:689610/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:781270/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:826659/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:935977/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:950341/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1386924/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1040041/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1082622/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1092379/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1247277/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1266997/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1269278/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1301569/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1326307/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1339891/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:180567/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1408234/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1573759/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1636424/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1607360/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1445059/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1566593/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1544383/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1538890/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1512336/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1468360/62‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGACTTTTAAGAATGcc  <  1:109259/62‑1 (MQ=255)  tGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:656963/61‑1 (MQ=255)  tGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:289370/61‑1 (MQ=255)  tGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1602791/61‑1 (MQ=255)  tGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:937338/61‑1 (MQ=255)          tgatgaCCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:1357065/53‑1 (MQ=255)                   gTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:89758/44‑1 (MQ=255)                            agaTGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGcc  <  1:249388/35‑1 (MQ=255)                                                              | CTGGCGCGGTGATGACCGGTAATCACGAGATGTACAAAGTCTTTACGCCTTTTAAGAATGCC  >  W3110S.gb/740338‑740399

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑