Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 773667 774139 473 102 [0] [0] 33 cydB cytochrome d terminal oxidase, subunit II

Only 100 of 102 total aligned reads displayed.

ATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCGCGGG  >  W3110S.gb/773605‑773666
                                                             |
aTTTTGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1602799/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:362243/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:651139/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:63023/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:592016/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:555429/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:551449/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:499344/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:485319/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:477120/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:471178/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:455691/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:430482/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:66689/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:353808/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:319495/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:283363/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:281773/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:276056/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:274120/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:246656/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:236410/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1003204/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:172286/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:856936/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:966210/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:964693/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:964169/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:960739/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:954066/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:948517/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:912140/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:908340/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:902714/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:898954/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:865357/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:203102/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:846924/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:841963/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:830253/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:813796/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:796257/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:773220/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:725383/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:719830/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:69863/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:678490/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:118880/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1324414/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1648818/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1283989/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1280865/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:127021/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1268472/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1261902/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1231308/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:122190/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:121289/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1204146/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1316567/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1135489/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1127447/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1096594/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1095559/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1083882/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1071055/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1051389/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1050746/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1029652/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1020396/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1616121/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1591789/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1598072/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1608322/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1544348/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1329487/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1528665/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1514394/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1480823/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1475534/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1443397/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1616971/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1408832/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1386306/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1367663/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1347821/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1347306/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAAACAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:952558/62‑1 (MQ=255)
aTTATGATTAACTCCATTCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:793898/61‑1 (MQ=255)
 ttATGATTAACTCCATTTCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1114920/61‑1 (MQ=255)
 ttATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:311758/61‑1 (MQ=255)
 ttATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:166006/61‑1 (MQ=255)
 ttATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:919714/61‑1 (MQ=255)
 ttATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1581459/61‑1 (MQ=255)
 ttATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1570078/61‑1 (MQ=255)
 ttATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:112632/61‑1 (MQ=255)
 ttATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:395601/61‑1 (MQ=255)
 ttATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:592126/61‑1 (MQ=255)
        tAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1422619/54‑1 (MQ=255)
               aTTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCgcggg  <  1:1125734/47‑1 (MQ=255)
                                                             |
ATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCGCGGG  >  W3110S.gb/773605‑773666

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: