Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	957590	958562	973	46 [0]	[0] 131	[ycaP]–[serC]	[ycaP],[serC]

TGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGG  >  W3110S.gb/957528‑957589                                                              | tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:655897/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1027174/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:356286/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:36316/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:373284/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:387643/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:400960/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:467400/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:530506/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:556816/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:567271/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:285877/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:792881/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:84146/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:852882/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:882408/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:888218/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:893877/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:924551/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:926234/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:973607/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:990929/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:198437/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1041965/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1083228/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1111526/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1145498/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1247504/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1271595/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1284483/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1326415/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1363285/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1431529/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1437833/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1438003/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1442057/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1567602/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1624938/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1633985/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1648834/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:189231/62‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:215849/62‑1 (MQ=255)  ggCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1556685/61‑1 (MQ=255)  ggCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTAAgg  <  1:957713/61‑1 (MQ=255)       gCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:1401534/56‑1 (MQ=255)             cTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATgg  <  1:691953/50‑1 (MQ=255)                                                              | TGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGG  >  W3110S.gb/957528‑957589

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑