Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1008503	1008752	250	92 [0]	[1] 64	ycbY	predicted methyltransferase

TAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATC  >  W3110S.gb/1008457‑1008502                                              | tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:468828/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:635194/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:621210/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:611541/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:611020/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:598051/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:5887/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:577544/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:556706/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:526734/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:490645/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:488159/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:647778/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:457905/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:440010/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:416421/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:38477/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:378324/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:375766/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:362324/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:322501/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:31756/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1001800/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:847081/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:993748/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:968876/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:952820/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:939022/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:89759/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:889042/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:879391/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:868905/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:86439/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:8494/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:84767/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:291060/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:824163/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:811338/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:763046/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:755375/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:730206/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:729645/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:725757/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:709233/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:67323/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:651118/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1155774/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1312719/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1310267/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1308290/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1253465/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1238109/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1225352/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1210082/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1208300/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1204374/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1175558/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:115637/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1330000/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1136363/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1125973/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1111403/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1105863/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:109934/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1070369/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1052991/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1052669/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1033287/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1025168/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1593110/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:267871/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:247013/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:21638/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:181739/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:176965/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1648817/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1618167/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1609816/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1607599/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1595493/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:26926/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:154320/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1521443/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1519436/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1464485/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1441117/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1399051/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1392451/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1364408/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1358588/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATc  <  1:1350135/46‑1 (MQ=255) tAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCT‑GGTGTTCAGGCGATc  <  1:480606/45‑1 (MQ=38)                                              | TAAGGTTTACAGCGATTTAGACCTCTATCTCGGTGTTCAGGCGATC  >  W3110S.gb/1008457‑1008502

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑