Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1013279	1013812	534	40 [0]	[1] 35	[pqiA]–[pqiB]	[pqiA],[pqiB]

GCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGC  >  W3110S.gb/1013217‑1013278                                                              | gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTTACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:931942/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:585026/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1650572/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:27626/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:29363/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:375321/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:44284/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:485318/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:551154/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:582094/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:252885/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:67932/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:696911/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:789675/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:802861/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:906445/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:985119/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1380592/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1037763/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1081132/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1091202/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1159993/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1236042/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1267941/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1325888/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1592526/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1413620/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1437260/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1441388/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1579468/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCGCGAAGATGc  <  1:1402371/62‑1 (MQ=255) gCTGTATCTTCAGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1228479/62‑1 (MQ=255)  cTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:428684/61‑1 (MQ=255)  cTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1438479/61‑1 (MQ=255)  cTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:733042/61‑1 (MQ=255)  cTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1130089/61‑1 (MQ=255)  cTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:817644/61‑1 (MQ=255)  cTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGc  <  1:1015204/61‑1 (MQ=255)  cTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCGCGAAGATGc  <  1:26946/61‑1 (MQ=255)  cTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCGCGAAGATGc  <  1:186489/61‑1 (MQ=255)                                                              | GCTGTATCTTCCGGCTAATATTTTGCCCATCATGGTGACGGATTTATTAGGCTCGAAGATGC  >  W3110S.gb/1013217‑1013278

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑