Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1041428	1041573	146	57 [0]	[0] 40	appA	phosphoanhydride phosphorylase

ATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACTG  >  W3110S.gb/1041367‑1041427                                                             | aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:659743/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:326492/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:340263/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:348652/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:35827/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:360359/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:36732/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:384198/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:392974/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:419870/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:424971/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:448378/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:480647/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:534880/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:641194/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:275667/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:6971/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:71187/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:723229/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:837661/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:850631/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:874983/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:878223/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:881481/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:89168/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:910632/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:938444/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:943580/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:979984/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1486579/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:104031/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:105010/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1053217/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1076549/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1104601/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1182363/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1302425/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1322682/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:137379/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1378871/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1455503/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1475784/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1479901/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1026758/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1498807/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1576247/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1582126/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1610098/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1618389/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1631680/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:1634739/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:16827/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:196437/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:201057/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:215646/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:231099/1‑61 (MQ=255) aTGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACtg  >  1:258862/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATGTCGACGAGCGTACCCGTAAAACAGGCGAAGCCTTCGCCGCCGGGCTGGCACCTGACTG  >  W3110S.gb/1041367‑1041427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑