Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1094238	1094302	65	80 [0]	[0] 34	ycdT	predicted diguanylate cyclase

AGAAATTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCG  >  W3110S.gb/1094174‑1094237                                                                 | aGAAATTA‑TTTTTTTAATGAACTG‑‑AGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:869669/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCTATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:933319/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:383811/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:55884/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:557236/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:553469/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:525612/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:451494/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:439538/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:414147/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:413974/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:399541/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:606024/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:356965/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:350957/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:270992/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:184124/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1000386/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1646597/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1637025/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:71784/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:96420/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:958890/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:930500/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:902410/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:869817/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:864142/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:849708/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:726988/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:600843/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:694596/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:690744/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:68080/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:677651/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:658222/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:612402/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:611547/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:164684/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1105230/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1292670/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1633996/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1273811/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1267995/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1237862/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1221790/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:115857/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1137329/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1120856/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1278210/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1102286/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1088929/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1087393/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1077852/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1076768/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1066260/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1026229/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:100526/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1001141/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1343372/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1616671/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1603990/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1596655/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:148167/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:146402/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1458592/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1399211/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1393795/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1374653/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1367517/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1361776/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1355443/62‑1 (MQ=255)   aaaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1305803/62‑1 (MQ=255)    aaTTATTTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:65399/62‑1 (MQ=255)    aaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:511709/61‑1 (MQ=255)    aaTTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:538450/61‑1 (MQ=255)     atta‑ttTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1415752/60‑1 (MQ=255)      tta‑ttTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGGCCAATAAACGCCTTATTTCg  <  1:1562699/59‑1 (MQ=38)               ttAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:7266/51‑1 (MQ=255)                               tCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:245877/35‑1 (MQ=255)                               tCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCg  <  1:1063777/35‑1 (MQ=255)                                                                 | AGAAATTA‑TTTTTTTAATGAACTGACAGTTCAATCAGCATCAGCCCAAAAAACGCCTTATTGCG  >  W3110S.gb/1094174‑1094237

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑