Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1103402	1103930	529	71 [0]	[0] 87	[csgD]	[csgD]

ATTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACAATAA  >  W3110S.gb/1103341‑1103401                                                             | aTTTTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:89006/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTTCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:580329/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:542995/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:664919/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:644174/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:628800/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:623487/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:574632/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:557658/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:555712/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:713166/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:542051/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:520732/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:495371/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:46559/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:444633/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:417524/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1039213/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:786636/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:989248/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:945796/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:942396/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:941503/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:898140/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:887973/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:832572/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:806805/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:667493/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:769154/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:752971/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:726374/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:722090/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:721085/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:71674/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:415666/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1213777/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:40957/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1432100/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:142170/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1397810/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1385990/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1378065/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:125121/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1247793/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1486615/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1154481/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1136288/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1094365/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1090335/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:107721/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1073519/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1063889/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:105223/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1638242/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:405177/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:401112/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:378403/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:303567/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:272910/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:24860/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:234940/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:186537/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1544750/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1616098/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1602405/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1590507/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:156998/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1562602/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACaataa  >  1:1552710/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATAAACaataa  >  1:762310/1‑61 (MQ=255) aTTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATATAGTGATCAACaataa  >  1:570452/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATTGTTTAAGGTGCTGCAAGAGAGCTGTCGCCTGCAAAGAAGATTTAGTGATCAACAATAA  >  W3110S.gb/1103341‑1103401

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑