Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1139248	1139422	175	14 [0]	[0] 14	flgJ	muramidase

AACAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCA  >  W3110S.gb/1139186‑1139247                                                              | aaCAGATGACGGCGGGCAAATGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:1385192/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:1126487/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:1499670/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:1542685/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:1586683/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:611672/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:621468/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:650878/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:669419/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:789926/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:790236/62‑1 (MQ=255) aaCAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:95762/62‑1 (MQ=255)                     ggTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:755333/42‑1 (MQ=255)                       tCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCa  <  1:1461769/40‑1 (MQ=255)                                                              | AACAGATGACGGCGGGCAAAGGTCTGGGGCTTGCAGAGATGATGGTTAAACAGATGACGCCA  >  W3110S.gb/1139186‑1139247

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑