Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1180015	1180074	60	85 [0]	[0] 62	lolE	outer membrane‑specific lipoprotein transporter subunit

CCTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATC  >  W3110S.gb/1179976‑1180014                                       | ccTCTCCAGTGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:519354/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:487266/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:675929/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:660143/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:65309/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:636854/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:618250/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:569001/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:566831/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:534571/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:509505/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:716497/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:472595/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:425873/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:418723/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:399487/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:396860/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:395273/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:375623/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:364271/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:101444/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:861678/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:999735/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:972759/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:965846/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:952835/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:945896/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:942740/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:92010/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:88806/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:881431/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:362172/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:858244/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:854308/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:852995/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:828495/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:799024/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:796152/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:76928/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:73140/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:728697/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1260014/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1363048/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1339434/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1331445/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1327404/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1319412/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1308742/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1300140/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1294408/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1284765/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1274460/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:332717/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1214633/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1213356/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1158568/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1155141/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1148808/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1132276/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1131221/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1067548/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1063153/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1437883/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:349635/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:257447/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:235597/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:208956/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:169272/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1648985/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1638153/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1626639/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1620300/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1586874/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1561255/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1536350/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1522042/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1494703/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1458883/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1448742/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCATGCCATc  <  1:648581/39‑1 (MQ=255) ccTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTACTGCCATc  <  1:71613/39‑1 (MQ=255)  ctctCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:220340/38‑1 (MQ=255)  ctctCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1402718/38‑1 (MQ=255)  ctctCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:1046535/38‑1 (MQ=255)   tctcCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATc  <  1:407561/37‑1 (MQ=255)                                       | CCTCTCCAGCGATATCTATTTTATTGATTTCCTGCCATC  >  W3110S.gb/1179976‑1180014

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑