Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1218633	1218709	77	45 [0]	[0] 11	ymgC/ycgG	hypothetical protein/conserved inner membrane protein

GAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAG  >  W3110S.gb/1218579‑1218632                                                      | gAGTAAGGTTTTAGAATAGACATCAGCTGTATCACAATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1051203/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:654965/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:358415/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:386261/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:390428/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:405134/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:408180/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:411695/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:430490/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:474243/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:503308/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:51262/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:631600/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1040746/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:669838/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:67971/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:713386/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:864161/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:897730/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:904722/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:941995/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:942090/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:953932/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1540194/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1026072/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1184206/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1185082/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:121941/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1230383/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1283130/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1317570/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1412124/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1534571/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:344882/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:159635/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1617898/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1633475/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:163557/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:178211/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:195029/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:205733/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:22893/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:230586/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACAATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:254945/1‑54 (MQ=255) gAGTAAGGTCTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAg  >  1:1088947/1‑54 (MQ=255)                                                      | GAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAG  >  W3110S.gb/1218579‑1218632

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑