Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1222983	1222992	10	78 [0]	[0] 38	ycgH ycgH	ECK1157:JW5901+JW5176:b4491; hypothetical protein ECK1157:JW5176:b1170; hypothetical protein, C‑ter fragment

GTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTG  >  W3110S.gb/1222922‑1222982                                                             | gcgCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1387354/3‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAATTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1389078/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:333399/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:483264/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:405825/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:387959/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:377410/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:363669/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:359225/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:354148/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:484207/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:297433/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:289547/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:286382/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:275554/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:25150/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:205167/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:186399/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1647058/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1625648/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:822301/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:977216/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:942395/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:938519/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:925398/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:913004/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:885125/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:854712/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:832369/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:824200/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1603182/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:794393/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:791359/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:768348/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:724927/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:723035/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:717810/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:677438/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:563539/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:534720/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1196238/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1317715/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1316933/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1314935/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1311890/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1298888/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1272273/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1240789/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1239506/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1231855/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1341009/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1173031/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:114240/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1118526/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1110267/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1086446/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1082406/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1069570/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1030732/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1465231/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1602497/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1573913/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1568117/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1561392/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1542615/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1527245/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1468908/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1009835/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1456039/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1448852/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1446098/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1444088/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1440290/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1388573/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1388448/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:1365190/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGAGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:153301/1‑61 (MQ=255) gTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACAGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTg  >  1:32693/1‑61 (MQ=255)                                                             | GTGCGGGTGAAACGCGCTACATCGATCCTGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTG  >  W3110S.gb/1222922‑1222982

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑