Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1225382	1225853	472	44 [0]	[0] 100	[ycgI]	[ycgI]

GGTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTC  >  W3110S.gb/1225320‑1225381                                                              | ggTAATTTTGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:418383/62‑1 (MQ=255) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:684520/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:328022/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:335142/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:426102/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:473380/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:551939/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:58237/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:582893/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:628710/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:67163/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1061910/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:731514/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:738709/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:812603/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:834303/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:837711/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:922653/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:927567/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:959742/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:965346/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:155683/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1099079/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1112657/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1154540/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1156534/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1187036/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1217619/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1269524/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1297061/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:137812/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1400020/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1400126/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1454577/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1465498/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1491842/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1518556/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1519870/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:243243/62‑1 (MQ=40) ggTAATTTCGTCAATGATTTGACGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:1159093/62‑1 (MQ=255) agTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:981169/61‑1 (MQ=255)  gTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:833236/61‑1 (MQ=40)  gTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:105197/61‑1 (MQ=40)                            aGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTc  <  1:745065/35‑1 (MQ=40)                                                              | GGTAATTTCGTCAATGATTTGTCGGGCAGACGTGGAATATACCAGGCAGCTATTAAAGCCTC  >  W3110S.gb/1225320‑1225381

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑