Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1240755	1240874	120	44 [0]	[0] 68	dadX	alanine racemase 2, PLP‑binding

AGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGT  >  W3110S.gb/1240695‑1240754                                                            | aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:608566/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1023072/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:325739/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:371006/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:403350/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:409662/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:414511/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:460669/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:507364/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:511806/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:562063/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:29808/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:624972/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:631006/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:657489/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:697461/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:707444/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:75632/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:758594/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:845217/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:854779/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:962982/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1446973/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1025093/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1038383/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1076784/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1122295/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1203569/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1291863/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1401697/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:141451/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1439324/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1486704/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1487874/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1554850/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1569776/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1613342/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1614422/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:1648949/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:184881/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:201324/60‑1 (MQ=255) aGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:275116/60‑1 (MQ=255)  ggATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:820774/59‑1 (MQ=255)   gATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGt  <  1:292977/58‑1 (MQ=255)                                                            | AGGATTTTTCCATGCTCAGGATCTGGAGATTTATGACCAGCACCGCCTGACCACCTGCGT  >  W3110S.gb/1240695‑1240754

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑