Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1247074	1247552	479	86 [0]	[0] 46	[ycgY]–[treA]	[ycgY],[treA]

AATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATG  >  W3110S.gb/1247013‑1247073                                                             | aaTATTCAGGTATCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1411439/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCTGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1379323/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:460494/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:639776/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:630517/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:611996/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:600836/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:547463/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:542516/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:517638/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:511883/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:47539/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:65242/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:4584/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:435681/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:424115/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:414652/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:407455/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:373297/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:312030/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:304053/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:27662/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:264018/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:813729/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:966155/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:937980/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:925469/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:885942/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:879084/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:86078/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:845599/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:821769/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:82130/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:820496/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:252796/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:805158/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:80027/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:782345/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:771036/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:763086/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:747/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:673427/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:671821/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:659081/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1186650/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1005955/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1368407/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1366471/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1355992/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1351879/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:130779/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1295249/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1275684/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1271226/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1200730/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1382123/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1185200/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1166685/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1132647/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1095438/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1086375/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1059219/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1057387/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:105403/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1050325/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1579475/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:237757/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:235767/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:18692/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:176416/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1627093/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1613804/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1605449/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:158673/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1385984/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1540395/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1538207/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1503484/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1490606/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1488502/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1451709/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:144858/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1443853/61‑1 (MQ=255) aaTATTCAGGTAGCAATTGATGCATTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:398210/61‑1 (MQ=255)  atatTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:115535/60‑1 (MQ=255)                          tatataGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGtgatg  <  1:1469664/36‑1 (MQ=255)                                                             | AATATTCAGGTAGCAATTGATGCTTTATATAGCCAACGTCGGCGTAAATCGCCGGGTGATG  >  W3110S.gb/1247013‑1247073

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑