Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1277976	1278191	216	75 [0]	[3] 52	narX	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL

GGCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCAA  >  W3110S.gb/1277914‑1277975                                                              | ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATGGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:174343/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:176252/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:415964/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:381753/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:328043/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:250064/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:211540/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:210969/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:190991/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:182655/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:421226/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:168458/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1649361/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:16278/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1627737/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:100221/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1564889/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:834699/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:966933/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:956134/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:954498/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:954322/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:927120/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:892303/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:890655/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:857416/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1603056/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:7744/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:731296/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:686322/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:644470/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:605989/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:590777/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:489324/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1290017/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1025858/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1033239/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1120105/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1151487/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1176199/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1188536/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1228728/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1234868/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1241007/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1267232/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1273628/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1290569/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1303241/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1304006/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1437546/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1464174/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1454815/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1447645/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1442630/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1306684/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:142676/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1369011/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1353727/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1316576/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1333914/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1347038/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1364962/62‑1 (MQ=255) ggCTGCTTTCTGGCAGCGAATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1587839/62‑1 (MQ=255)  gctgctTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:962059/61‑1 (MQ=255)  gctgctTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1027810/61‑1 (MQ=255)  gctgctTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1156261/61‑1 (MQ=255)  gctgctTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1642824/61‑1 (MQ=255)  gctgctTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:843400/61‑1 (MQ=255)  gctgctTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1223722/61‑1 (MQ=255)  gctgctTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1506189/61‑1 (MQ=255)  gctgctTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1285660/61‑1 (MQ=255)  gctgctTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:691661/61‑1 (MQ=255)  gcggctTTCTGGCAGCTCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:1240163/58‑1 (MQ=255)    tgctTTCTGGCAGGGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:268886/59‑1 (MQ=255)                      cGCCCTTCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCaa  <  1:875014/41‑1 (MQ=255)                                                              | GGCTGCTTTCTGGCAGCGCATCGCCCTGCATCTGTAAACAACTCACCTGCATCTTCATGCAA  >  W3110S.gb/1277914‑1277975

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑