Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1290486	1290586	101	99 [0]	[0] 71	ychJ	conserved hypothetical protein

AACTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAC  >  W3110S.gb/1290424‑1290485                                                              | aaCTGTCAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:34206/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:256169/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:376708/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:371353/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:371329/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:361531/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:30708/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:289630/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:287604/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:274042/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:418791/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:233704/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:231933/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:200346/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:192001/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:164804/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1629643/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1626016/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1619955/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1584816/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:620184/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:996943/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:92036/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:895093/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:844742/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:817846/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:796670/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:784869/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:754587/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:621910/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1029610/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:604740/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:603699/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:600939/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:540307/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:494322/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:467819/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:439732/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:434661/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1417553/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1210098/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1206412/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1203381/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1199563/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1307861/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1191181/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1166128/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:109211/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1367532/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1086360/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1383233/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1421296/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:142964/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1046136/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1555490/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1535604/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1034300/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:104024/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1500902/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1072125/62‑1 (MQ=255) aaCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1457172/62‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1072703/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:682352/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:107348/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:867912/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:727709/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1585163/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:583513/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:77673/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:536278/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:536085/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:971817/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:737288/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1625675/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1630304/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1508839/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:181228/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:18785/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1455403/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1431901/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:242445/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1510666/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:282566/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1617623/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:136575/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1324493/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:131040/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1293216/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:394636/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:397254/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1268098/61‑1 (MQ=255)  aCTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1229444/61‑1 (MQ=255)   cTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:100102/60‑1 (MQ=255)   cTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1391778/60‑1 (MQ=255)     gACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:295555/58‑1 (MQ=255)      aCAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:730169/57‑1 (MQ=255)       cAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTGAATCCCAAc  <  1:904990/56‑1 (MQ=255)                          gTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1071098/37‑1 (MQ=255)                            ccTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAc  <  1:1259281/35‑1 (MQ=255)                                                              | AACTGACAAATCCGATATTGTCGGCGTCCTGCCAACAATGTTCAAATACGGTCAATCCCAAC  >  W3110S.gb/1290424‑1290485

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑