Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1302445	1302708	264	58 [0]	[0] 6	insD/oppA	IS2 element protein/oligopeptide transporter subunit

CCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTC  >  W3110S.gb/1302383‑1302444                                                              | ccACTGCGTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1407647/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:534259/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:224513/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:226154/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:246496/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:248823/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:300049/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:301475/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:316693/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:3275/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:339464/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:383483/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:404866/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:520246/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:528372/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:217560/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:564961/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:619974/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:681257/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:692417/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:728859/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:739785/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:742031/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:756339/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:77936/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:813730/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:887477/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:925868/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:931393/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:977702/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1394305/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1011746/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1026234/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1039050/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1051175/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1051791/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1093685/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1117889/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1147506/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1191387/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1227713/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1271409/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1271414/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:127882/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1008630/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1396123/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1442578/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1512953/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1517459/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1523921/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1534625/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1547903/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1558359/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1590825/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1627879/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:1640460/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:183015/1‑62 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc  >  1:207551/1‑62 (MQ=255)                                                              | CCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTC  >  W3110S.gb/1302383‑1302444

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑