Missing coverage evidence...
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TCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAG  >  W3110S.gb/1389396‑1389456                                                             | tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:176255/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:995598/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:975867/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:860356/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:858384/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:784020/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:759883/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:73159/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:566153/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:515319/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:513471/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:377214/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:262040/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:202295/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1078812/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1628792/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1626899/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1584513/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1577918/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1563770/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1555042/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1496394/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1365955/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:136167/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1280301/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1172220/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1170334/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1151552/61‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:1125722/61‑1 (MQ=255)           gAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCagaag  <  1:20280/51‑1 (MQ=255)                                                             | TCGGGTTGGCGAAGACCATGAGGTGCATGTCGATGTGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAG  >  W3110S.gb/1389396‑1389456

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑