Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1392337	1392783	447	37 [0]	[0] 17	[mpaA]–[ycjY]	[mpaA],ymjC,[ycjY]

AATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAT  >  W3110S.gb/1392275‑1392336                                                              | aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGTGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1195531/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:625843/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:235246/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:294510/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:376872/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:38381/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:434479/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:465599/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:565031/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:604404/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:613133/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1646253/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:627970/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:749459/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:785008/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:80367/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:87029/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:876911/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:992316/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1431954/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1122217/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1135871/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1143074/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1211023/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1234035/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1263344/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1346409/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:135307/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1074037/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1455099/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1563823/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1585738/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1588085/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1589804/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1615269/62‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:1635309/62‑1 (MQ=255)             tCGGCGCGTTGGCTGGTTACTGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAt  <  1:576130/50‑1 (MQ=255)                                                              | AATGCGCCGCGTTCGGCGCGTGGGCGGGTTACGGTCATGATCGTCTCTGGTTCAGGAAGTAT  >  W3110S.gb/1392275‑1392336

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑