Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1412843	1413673	831	76 [0]	[0] 39	[ydaO]	[ydaO]

TGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCACCCC  >  W3110S.gb/1412803‑1412842                                        | tGTAGTGGTATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:356665/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGGTCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1044629/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:475187/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:604615/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:601579/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:590011/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:589919/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:582324/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:523536/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:515265/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:507225/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:498707/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:650170/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:414029/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:410389/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:396090/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:369565/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:343588/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:342935/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:335681/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:778022/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:994242/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:960229/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:945610/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:927429/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:903912/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:896347/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:847162/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:83989/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:808814/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:641592/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:777005/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:743898/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:727588/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:711076/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:709172/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:680226/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:670263/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:298202/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1275888/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1453763/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1436119/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1430120/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:142778/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1390802/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1333866/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1314076/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1284412/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:269341/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1239906/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1238400/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1211619/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1164951/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:114824/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1104995/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:108115/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1013041/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1490108/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:265331/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:260581/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:257441/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:254963/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:253205/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:251974/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:183392/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1612327/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1603336/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1560936/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1549789/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1546998/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1521956/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:151559/40‑1 (MQ=255) tGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1501099/40‑1 (MQ=255) agTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1417401/39‑1 (MQ=255)  gTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1007959/39‑1 (MQ=255)   tAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCAcccc  <  1:1459799/38‑1 (MQ=255)                                        | TGTAGTGGGATCTCTTCGCGATCAAACGCCAGATCACCCC  >  W3110S.gb/1412803‑1412842

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑