Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1531249	1531348	100	34 [0]	[0] 18	rhsE	rhsE element core protein RshE

AGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAT  >  W3110S.gb/1531187‑1531248                                                              | aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:408945/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:160322/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1630746/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:170712/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:201493/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:343003/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:353030/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:380268/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:385736/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1600660/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:447022/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:522234/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:710339/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:793349/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:813946/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:81503/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:897433/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1469459/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1120795/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1130046/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1196811/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1224569/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1354891/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1355353/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1427779/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1033831/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1504008/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1543360/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1546244/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1572853/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1574710/62‑1 (MQ=255) aGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1589351/62‑1 (MQ=255)  gACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1445034/61‑1 (MQ=255)  gACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAt  <  1:1482963/61‑1 (MQ=255)                                                              | AGACCCAATGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTAT  >  W3110S.gb/1531187‑1531248

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑