Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1532237	1532693	457	84 [0]	[0] 14	[yncI]	[yncI]

AGGGCAAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTT  >  W3110S.gb/1532185‑1532236                                                    | agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATGACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1520215/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:463886/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:55712/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:544550/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:535001/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:5319/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:516084/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:497323/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:485536/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:475680/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:464191/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:560764/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:459287/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:406036/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:404372/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:388423/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:373299/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:329560/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:269275/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:202966/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:195136/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:740829/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:989154/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:976499/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:974303/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:971979/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:895029/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:878667/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:836493/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:802779/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:750768/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:748123/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:18740/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:719030/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:698764/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:675642/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:659270/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:65411/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:635958/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:635485/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:603719/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:603261/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1183992/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1012819/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1386051/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1303365/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1287190/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1285543/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1274252/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1235875/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1225549/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1225310/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1222825/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1390494/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1155850/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1153548/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1139284/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1122521/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1120811/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:110321/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1078233/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1075390/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1034423/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1412882/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:177920/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:176022/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:169799/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1633404/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:160377/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1597817/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1589470/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1560164/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1535509/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1523677/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1519342/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1517645/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1516940/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1461041/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:142749/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1426142/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1414893/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1407569/1‑52 (MQ=255) agggcaAGATAATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:423855/1‑52 (MQ=255) aaggcaAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCttt  >  1:1190163/3‑52 (MQ=255)                                                    | AGGGCAAGATCATGAAAATTGTGATGTAAATCACGATTTTCATCTTTGCTTT  >  W3110S.gb/1532185‑1532236

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑