Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1578547	1578550	4	40 [0]	[0] 6	yddB	predicted porin protein

GCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAC  >  W3110S.gb/1578485‑1578546                                                              | gCTGGCAAACCAGGTAAGTTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:554613/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGTAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1481550/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:356304/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:339433/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:359133/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:406167/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:416347/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:476879/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:478854/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:518279/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:587745/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:620854/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:681027/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:754605/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:785848/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:787320/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:89747/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:926987/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:947088/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:982590/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:99770/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1542787/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1069158/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1179290/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1196355/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1237444/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1271053/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1285860/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1371681/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:138415/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1414523/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:101190/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1562423/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1597950/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:1615722/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:196461/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:208248/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:253276/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:308280/62‑1 (MQ=255) gCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAc  <  1:318828/62‑1 (MQ=255)                                                              | GCTGGCAAACCAGGTAAATTTGCTTAATGCAGTATCGATAACGTTTTTATACTGTGCCCGAC  >  W3110S.gb/1578485‑1578546

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑