Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1582863	1582964	102	42 [0]	[0] 77	ydeN	conserved hypothetical protein

TTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTG  >  W3110S.gb/1582818‑1582862                                             | ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:622855/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:222198/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1108414/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:289781/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:321947/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:394065/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:423183/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:425334/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:484604/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:52682/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:247740/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:758639/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:773910/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:828099/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:851955/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:855504/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:904995/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:931128/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:957181/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:958086/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1402657/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1135585/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1146634/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1218029/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1222249/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1222941/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1384295/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:139794/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:204079/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1521910/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1537037/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1558307/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1579004/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:161986/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1642018/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:181449/45‑1 (MQ=255) ttGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:198888/45‑1 (MQ=255) gtGGGGTTATGCGGGTAATCGGCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1358306/44‑1 (MQ=39)      gTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:1328669/40‑1 (MQ=255)         aTGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:665493/37‑1 (MQ=255)           gCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:340660/35‑1 (MQ=255)           gCGGGTAATCGGCTGACTGATGGCGAACAAATTtg  <  1:260605/35‑1 (MQ=255)                                             | TTGGGGTTATGCGGGTAATCGTCTGACTGATGGCGAACAAATTTG  >  W3110S.gb/1582818‑1582862

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑