Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1592908	1593312	405	33 [0]	[0] 55	hipA	regulator with hipB

GCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGC  >  W3110S.gb/1592847‑1592907                                                             | gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:75293/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:317724/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:568309/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:57186/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:635805/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:650968/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:662188/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:670100/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:679171/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:2918/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:777379/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:778257/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:800962/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:809529/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:823528/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:862762/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:994573/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1079230/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:267267/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:248036/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:216864/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1742/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1635535/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1566554/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1558637/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1432815/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1351238/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1269608/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1266437/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:120565/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1157168/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1146853/1‑61 (MQ=255) gCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGc  >  1:1089030/1‑61 (MQ=255)                                                             | GCTGATGTGTATTCCCGTACCGCCAAGGACCGGAAATGCTGAAATGATGTCGTAAAATGGC  >  W3110S.gb/1592847‑1592907

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑