Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1596395	1596513	119	45 [0]	[0] 13	ydeK	predicted lipoprotein

CCTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAT  >  W3110S.gb/1596334‑1596394                                                             | ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGTCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACTCAt  >  1:496222/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:628893/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:244973/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:264292/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:289946/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:324237/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:332609/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:340922/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:435708/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:451574/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:459989/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:574782/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:229579/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:723698/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:754322/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:76901/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:796746/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:833264/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:875752/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:906011/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:928478/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:957260/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:970509/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1422534/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1056978/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1086153/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:108771/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1116229/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1193556/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:120615/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1223028/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1295202/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1360564/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1381859/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1006945/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:142770/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1467552/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1490549/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1574500/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1600770/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1637674/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1640903/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1641277/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:180891/1‑61 (MQ=255) ccTAACCCCTCAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAt  >  1:1460881/1‑61 (MQ=255)                                                             | CCTAACCCCTGAGTATTATCGAGGCTGACTTCCGCATTTGGGCTAATGCTGGTTAACGCAT  >  W3110S.gb/1596334‑1596394

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑