Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1674084	1674575	492	86 [1]	[0] 6	[ydgD]–[mdtI]	[ydgD],[mdtI]

GCGTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGTACCTC  >  W3110S.gb/1674029‑1674088                                                       |      gcgTTGATCCGACACTGGGAAGGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1362990/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:493878/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:627738/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:618092/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:608590/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:596360/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:547201/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:539314/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:533397/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:517240/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:504882/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:494466/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:641071/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:488918/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:487432/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:482795/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:463336/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:461609/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:459857/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:443737/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:402482/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:402043/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:358783/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:845771/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:998184/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:955567/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:928076/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:923433/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:915719/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:912112/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:90308/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:902719/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:888732/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:887402/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:347075/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:84167/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:78935/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:729133/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:70546/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:693460/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:687445/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:686882/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:649169/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:642133/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1329775/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1445014/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1436663/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1412425/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1408214/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1402033/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1391310/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:13668/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1362319/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1361512/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1349394/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1492932/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1293323/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1251544/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1216696/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:121148/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1204687/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:119070/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1169257/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1142010/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1070724/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1507146/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:325645/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:316749/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:310063/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:309461/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:290479/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:278420/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:236394/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:229210/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:226371/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:215663/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1637220/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1619256/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1604393/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:15886/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1575336/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1557889/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1520932/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1018822/1‑55 (MQ=255) gcgTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGTAccag  >  1:1577144/1‑58 (MQ=255) gcgTTGATCCGAAACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGt       >  1:1638585/1‑55 (MQ=255)                                                       |      GCGTTGATCCGACACTGGGAAAGCGGTTAAAAGCAGATGGGGATGGTTGGATTGTACCTC  >  W3110S.gb/1674029‑1674088

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑