Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1705837	1705838	2	59 [0]	[0] 94	ydgJ	predicted oxidoreductase

GCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGG  >  W3110S.gb/1705775‑1705836                                                              | gcTTTTGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1244004/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGTGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:608287/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGACTGACAATCAGGTCTCTGTTggg  <  1:1496300/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:581192/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1511653/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1012551/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1560734/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1565736/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:178927/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:232286/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:42273/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:423977/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:428642/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:469664/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:469927/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:580247/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1556734/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:599125/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:623999/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:634541/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:640149/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:713327/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:779241/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:79600/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:839369/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:915676/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:91847/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:923428/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1305281/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1044189/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:104660/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:104914/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1061540/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1183377/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1223959/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1250643/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1263472/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1269273/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1275666/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:128247/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1313289/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1346529/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1483200/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1473367/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1471526/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1444067/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1406546/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1388946/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:134903/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1345639/62‑1 (MQ=255) gcTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATAGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1504078/62‑1 (MQ=255)  cTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:666034/61‑1 (MQ=255)  cTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:30704/61‑1 (MQ=255)  cTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:255158/61‑1 (MQ=255)  cTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1469092/61‑1 (MQ=255)  cTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:907680/61‑1 (MQ=255)  cTTTGGCTAAC‑GGTAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:910715/60‑1 (MQ=255)                aaaTGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:1425334/47‑1 (MQ=255)                          cGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTggg  <  1:854845/37‑1 (MQ=255)                                                              | GCTTTGGCTAACGGGAAATGGGTATCGTTGGGTGTAGGAATGACAATCAGGTCTATGTTGGG  >  W3110S.gb/1705775‑1705836

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑