Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1720795	1720795	1	68 [0]	[0] 7	ydhH	conserved hypothetical protein

TACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGA  >  W3110S.gb/1720743‑1720794                                                    | tACCAGGCCCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1291640/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:420474/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:612459/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:592048/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:536537/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:53285/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:526349/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:499451/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:424292/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:630511/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:410868/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:404116/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:398250/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:380503/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:372925/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:330469/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:313899/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:284412/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:791476/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:986517/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:977383/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:947677/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:911199/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:857806/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:85373/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:834117/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:791620/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:624457/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:778658/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:775316/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:755419/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:742632/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:715773/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:670506/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:27203/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1240085/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1474350/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:142390/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1411641/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1382134/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1370318/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1325934/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1261869/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1251070/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1476058/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1238585/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1224950/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1186517/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1106419/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1088591/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:103042/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1021989/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1010026/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1477968/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1483159/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1499684/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:150428/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1538054/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:156698/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1575835/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:160996/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1610330/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:1624832/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:190785/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:192461/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:219872/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:224168/1‑52 (MQ=255) tACCAGGACCGGAATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGa  >  1:151580/1‑52 (MQ=255)                                                    | TACCAGGACCGGTATCGTAGCCCCCAACCGGCTGCCCAGGAATGAGCAGTGA  >  W3110S.gb/1720743‑1720794

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑