Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1750229	1750319	91	88 [0]	[1] 104	ydhS	conserved hypothetical protein with FAD/NAD(P)‑binding domain

GCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAT  >  W3110S.gb/1750168‑1750228                                                             | gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTTGGCTACGCGAGCAAt  <  1:197580/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:337702/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:663471/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:623659/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:613598/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:607308/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:581294/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:580347/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:499649/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:449107/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:375960/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:347042/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:664028/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:336729/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:320995/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:314424/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:311985/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:309680/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1027767/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:306741/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:304791/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:820999/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:974429/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:973719/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:932101/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:924648/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:903087/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:883125/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:876556/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:849940/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:843943/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:827423/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:307164/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:794160/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:793616/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:785666/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:778596/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:778580/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:77632/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:746868/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:745922/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:680757/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1227635/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1433789/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1401855/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1384963/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1337071/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1333692/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1305629/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1293171/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1292863/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1291467/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1280475/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:141109/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1129173/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:111123/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1106995/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:11048/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1091829/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:108693/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1082783/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1072814/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1061067/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1547973/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:238213/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:232367/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:224809/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:218526/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:199875/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:186331/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:165968/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1649779/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:160386/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1553067/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1449517/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1534251/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1477612/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1463604/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1456837/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1452602/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGACCAAt  <  1:484910/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTCCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:26116/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCACTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1486433/61‑1 (MQ=255)    cgcgGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:913515/58‑1 (MQ=255)                  gCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:868588/44‑1 (MQ=255)                       aaGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:723992/39‑1 (MQ=255)                       aaGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:6759/39‑1 (MQ=255)                          tGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:611604/36‑1 (MQ=255)                                                             | GCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAT  >  W3110S.gb/1750168‑1750228

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑