Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1851380	1851457	78	62 [0]	[0] 53	sppA	protease IV

TGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAC  >  W3110S.gb/1851318‑1851379                                                              | tGGCGCGCAAGGGTTGGTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACAGCGAAATATGCAc  >  1:424105/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTACCCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATTCAc  >  1:168020/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:432638/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1646015/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:209071/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:219877/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:230034/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:230399/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:243343/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:249516/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:252858/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:334279/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:350946/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:352168/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:37175/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:388227/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1614677/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:487183/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:538835/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:582703/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:624911/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:637245/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:669892/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:722395/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:759960/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:791076/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:830494/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:849722/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:873178/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:980172/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:997155/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1346072/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1041182/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1064107/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1130965/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:116661/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:118285/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1185499/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1225227/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1262390/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1302294/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1306500/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1318908/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1332316/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1332944/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1343459/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1345113/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1025426/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1350408/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1358831/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1359967/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1371391/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1380567/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1388075/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1449632/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1464056/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1464601/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1465174/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1484538/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1537443/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1539216/1‑62 (MQ=255) tGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAc  >  1:1541591/1‑62 (MQ=255)                                                              | TGGCGCGCAAGGGTTGCTTGAGGGTTTAACCAAAACCGGTGGCGATACCGCGAAATATGCAC  >  W3110S.gb/1851318‑1851379

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑