Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1851990	1852056	67	48 [0]	[0] 7	sppA	protease IV

CTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAG  >  W3110S.gb/1851928‑1851989                                                              | cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:738520/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1022279/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:356970/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:372312/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:408673/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:452495/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:496739/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:542855/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:552859/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:558262/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:586809/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:665869/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:326645/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:745784/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:790681/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:823313/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:83081/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:832646/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:903440/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:929710/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:945937/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:970723/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:977943/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:236628/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1187107/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1198371/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:119914/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1205680/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1216165/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1261959/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1267946/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1275873/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1291593/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1295247/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1369629/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1498304/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1511721/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1515181/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1538811/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1588827/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1615565/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:279653/62‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAACTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1562562/62‑1 (MQ=255)  tGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGGCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:816954/61‑1 (MQ=255)          gTTTCTATCACCAGGGCCCTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:328653/53‑1 (MQ=255)                  cACCAGCGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1464659/45‑1 (MQ=255)                       gggCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1150181/40‑1 (MQ=255)                         gCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAg  <  1:1230310/38‑1 (MQ=255)                                                              | CTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAG  >  W3110S.gb/1851928‑1851989

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑