Missing coverage evidence...
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TACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGT  >  W3110S.gb/1910603‑1910637                                   | tACGATTAAGCTAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:628628/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:766787/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:455627/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:479036/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:488115/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:561058/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:71009/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:711454/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:71345/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:372987/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:822544/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:883356/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:890977/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:923964/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:928843/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:966222/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:973340/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1428825/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1125244/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1140452/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1158259/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1168836/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1297846/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1317824/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1330171/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1403381/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1109363/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1500629/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:15433/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1615635/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:1625992/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:234914/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:301574/1‑35 (MQ=255) tACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGt  >  1:328143/1‑35 (MQ=255)                                   | TACGATTAAGCGAACATAAAAAGAGAAGAGGTTGT  >  W3110S.gb/1910603‑1910637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑